El Observatorio trabaja dos líneas de investigación, cada una de las cuales abarca varias categorías de análisis:

a) Protección y garantías de seguridad a la población objeto de protección, según el Decreto 299 de 2017, relacionado con el Acuerdo Final de Paz

Con esta línea se busca realizar un riguroso seguimiento de las condiciones de seguridad, protección y garantía de derechos a la población firmante, entornos, lideres/as, así como a distintos colectivos que por sus características sean objeto de vulneración de derechos, referenciados en el marco de los subpuntos 3.4 y 2.1 del Acuerdo Final de Paz, y que requieren del acompañamiento y garantías de las diferentes disposiciones de protección constitucional y legal.

• Categorías de análisis: atentados, amenazas, homicidios, secuestros, desaparición forzada, desplazamiento forzado, extorsiones, confinamiento, estigmatización, violación de derechos políticos.

b) Gestión y resolución pacífica de conflictos

Mediante la observación y la investigación se identifican victimizaciones (vulneraciones a los DDHH y al DIH) y se analizan las causas y motivaciones de los conflictos que afectan de algún modo a la población objeto de protección y relacionada con el Acuerdo de Paz y a sus entornos comunitarios, a partir de lo cual se diseñan estrategias y actividades enfocadas a prevenir el aumento de tensiones comunitarias, políticas y sociales y se propende por transformar relaciones de confrontación, agresión y estigmatización en relaciones de reconocimiento, respeto, colaboración, confianza y reconciliación para la convivencia pacífica en los territorios. 

• Categorías de análisis: violencia de género, discriminación, maltrato infantil, Conflictos interétnicos, conflictos ambientales, reconciliación, construcción de espacios de paz.

I. Área técnica

Se encarga de la recolección, sistematización, organización y consolidación de la información; para ello se estructura bajo dos sistemas:

a) Sistema de información, SI:

Es la plataforma tecnológica en la cual se almacenan, clasifican y consultan de manera permanente los datos relacionados con el problema o fenómeno objeto de la investigación. La plataforma maneja tres dimensiones que se concretizan en su banco de datos, como: de tiempo, relacionada con el estado, actualización y disponibilidad de la información. De contenido, la cual refiere al tratamiento de la información, cuyas relatorías obedecen a las reglas básicas de construcción textual, sin errores, concisa, completa, con un enfoque amplio y centrado. De forma, que obedece a la presentación y disposición de la información de acuerdo con el momento y lugar que se requiera, con cifras reales, sencilla de entender, detallada y ordenada.

b) Sistema de información geográfica, SIG:

Posibilita el análisis geoestratégico de los territorios afectados por diferentes actores, permite la creación de mapas que representan gráficamente la ubicación espacial y el comportamiento de los fenómenos investigados y monitoreados por el Observatorio, permite la focalización para la implementación eficiente de las acciones de prevención frente a la vulneración de derechos y amenazas a la seguridad, permitiendo el análisis de contextos regionales.

II. Área de investigación y análisis

Realiza la lectura e interpretación de la información y traza las estrategias para la incorporación de datos mediante el análisis y resultados. Elabora descripciones y construye teorías de acuerdo con las problemáticas estudiadas. Para lograr los resultados se sigue un procedimiento de cuatro pasos como son: 

a) Plantea el problema u objeto de la investigación, haciendo una descripción precisa de la situación, lo cual permite demarcar la focalización o la territorialidad.

b) Precisa la metodología: que entrelaza elementos cualitativos y cuantitativos de la información que brinda el SI para, en una primera etapa, validarla o no mediante el análisis de los datos recolectados con las técnicas empleadas por el Observatorio. Se ciñe a la implementación del plan para la recolección de la información, a la movilización y numero de entrevistadores, como al control del trabajo de campo.

c) Recolecta y procesa la información de fuentes primarias o directas, así como de fuentes secundarias, permitiendo la lectura e interpretación de la información consolidada y ordenada por el SIG para ser organizada, producir los informes, diagnósticos y análisis estratégicos.

d) Recauda la información en un banco de datos y direcciona los hallazgos hacia la implementación real de políticas públicas de protección a la población focalizada. Igualmente, se proyecta para hacer parte de la Red Nacional de Bancos de Datos de derechos humanos y violencia política.

III. Área pedagógica

Esta área define los modelos pedagógicos, las didácticas y las metodologías de intervención frente a los procesos de capacitación en prevención, seguridad y difusión de los DDHH. Para ello focaliza la intervención, los espacios territoriales y las poblaciones objeto del proceso formativo y de divulgación; define las estrategias didácticas para que en los territorios se replique la experiencia, se multipliquen los saberes y se formen los defensores/as de DDHH. Asimismo, orienta sobre la gestión, partiendo desde los territorios en el marco de los enfoques requeridos.

IV. Área de comunicaciones

Es un área interdependiente con las demás y desarrolla las siguientes funciones:

a) Obtiene la información (publicaciones, informes oficiales, entrevistas, etc.)

b) Crea estrategias de información (piezas comunicativas virtuales y físicas) para la circulación y socialización de los informes.

c) Organiza la información una vez depurada, a manera de conservación de las memorias de los procesos, retroalimentado el banco de datos del Observatorio.

d) Realiza la presentación y socialización de los resultados obtenidos.

e) Dispone de un centro de documentación como espacio de consulta permanente.